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研究揭示疾病突变对蛋白质相互作用的综合影响

2021-02-14 12:44:29来源:中国科学报阅读数:0
核心提示:基因组学和相互作用组学的技术和计算进展使人们能够确定疾病突变如何扰乱人类细胞内的PPI网络。

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美国哈佛医学院Joseph Loscalzo研究小组揭示了疾病突变对蛋白质相互作用的综合影响。近日,《自然—遗传学》杂志在线发表了这项成果。

研究人员表明,与疾病相关的种系变体相比,从项目1000 Genomes和ExAC的健康参与者中鉴定出的变体在编码蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)接口的序列中显著富集。与10,861个肿瘤外显子组中的非接口相比,PPI接口中的体细胞错义突变也显著富集。研究人员在全癌分析中通过计算确定了470种可能的oncoPPI,并证明oncoPPI与患者生存率和耐药性/敏感性高度相关。

研究人员使用系统性二元相互作用实验性地验证了13 oncoPPI的网络效应,并且还证明了其中的两个对肿瘤细胞生长的功能影响。

总而言之,这种人类相互作用组网络框架为区分具有PPI干扰突变的等位基因提供了一个有力的工具,从而可促进基于病理生物学机制和基因型的疗法发现。 

据介绍,基因组学和相互作用组学的技术和计算进展使人们能够确定疾病突变如何扰乱人类细胞内的PPI网络。


责任编辑:刘东丽

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